15 Temmuz 2016 hain darbe girişiminin ardından 2017 yılında gözaltına alındı. Serdar Atasoy 2020 yılında YAŞ kararlarıyla tuğgeneral yapılarak terfi ettirildi. Kara Kuvvetleri Komutanlığı İstihbarat Daire Başkanlığı emrine atanan Serdar Atasoy, 2021 ocak ayında emekli oldu. FETÖ'den tekrar gözaltına alındı. FETÖ içinde "Servet" kod adını kullandığını, kurmaylık sınav sorularının örgüt tarafından kendisine verildiğini ve teğmen rütbesini örgüt elebaşı Fethullah Gülen'in taktığını itiraf etti. Etkin pişmanlıktan yararlanarak serbest bırakıldı.